1994年12月29日,撤销浮岗集乡、李新庄乡,设立浮岗集镇、李新庄镇(鲁政函民字[1996]67号)。
1998年11月9日,撤销李半庄乡,设立莱河镇。1998年底,单县辖37个乡镇。 1999年12月22日,撤销杨楼乡,设立杨楼镇。
2001年,单县辖14个镇、6个乡:时楼镇、单城镇、莱河镇、孙溜镇、郭村镇、高韦庄镇、浮岗镇、黄岗镇、杨楼镇、蔡堂镇、朱集镇、终兴镇、徐寨镇、李新庄镇、谢集乡、高老家乡、曹庄乡、龙王庙乡、张集乡、李田楼乡。
2002年5月14日,省政府批复同意:单县撤销龙王庙乡,设立龙王庙镇,其行政区域和人民政府驻地不变。截至2002年12月31日,单县辖16个镇、4个乡。
县政府驻地原单城镇于2007年撤销,现设为南城、北城、东城、园艺四个街道办事处。截至2013年县城区面积126.2平方公里,人口61.8万人,其中非农产业人口57万人。
2010年10月撤销李田楼乡,以其原行政区域设立李田楼镇,镇政府驻原李田楼乡政府驻地;撤销谢集乡,以其原行政区域设立谢集镇,镇政府驻原谢集乡政府驻地;撤销孙溜镇,以其原行政区域设立东城街道办事处,办事处机关驻孙溜镇政府驻地。
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